在都市内出现了连续女性被杀事件。经警察调察，犯案者是异形怪物，而主角·风祭真因为一直发着相关事件的梦而备受困扰……
　　风祭真的父亲是遗传学研究所里的科学家。而真则自愿成为了研制不治之病的实验品，但却被疯狂的科学家·鬼塚实行的现阶段最危险的生化实验·Lv3的遗传因子操作实验而变成了生化战士：真·假面骑士。但鬼塚最大的目的就是要将真供幕后BOSS·“财团”作为军事武器。真最后逃出了『财团』的魔掌，并且与“财团”的超级改造战士·豪岛展开生死战！

　　为了夺取主人公等所在的宫国所持有的珍贵引擎，邻国开始了日益激烈的侵略。为了迎击敌国，宫国被迫将仪式用复座式飞行艇“Simoun”改造成了战斗用战舰。还需要未性别化的“巫女”被派遣担任驾驶员，于是，她们成为了被称为“coru”的战斗小队成员。
　　操纵“Simoun”的少数少女被称为了“Simoun·シヴュラ（西贝拉）”因为拥有着特殊能力，她们可以选择自己成为大人的时间。但是因为战争的爆发，她们的优秀才能不得不运用在“Simoun”的操作上，换句话说，她们被强迫保持在了“少女阶段”……

　　身在魔王军却不会使用魔法的暗黑士兵达利艾尔，
　　以自己的才智和行动力爬上了四天王辅佐之位大显身手。
　　然而在四天王刚一换代，达利艾尔就被解雇了。
　　大失所望的达利艾尔彷徨在森林中，无意间遇到了一名被怪物袭击的少女！
　　拯救了少女的达利艾尔在少女的“盛情招待”下来到了人类的村子。
　　本想在暴露自己是魔族之前溜之大吉的达利艾尔
　　却在少女的“请求”下留下来开始了冒险者之路。
　　「不是我不想拒绝，是她实在太大了」

　　科技发达的机械化理想国度，帝国。驱使超自然力量·星灵术，作为“魔女之国”受人畏惧的涅比利斯皇厅。两国的漫长战争仍在持续。
　　帝国最强战力伊思卡和别名“冰祸魔女”的皇厅公主爱丽丝莉洁在激战中逐渐了解对方的真心，被对方的人生理念和理想所吸引，成为了劲敌。
　　二人在独立国家阿尔萨米拉粉碎了帝国和皇厅的阴谋，约定改日再见后，走上了各自的道路，却以意外的形式实现了约定。
　　伊思卡和爱丽丝的妹妹希丝蓓尔达成交易，作为她的护卫潜入了皇厅。爱丽丝为了寻找希丝蓓尔，来到了皇厅的都市里斯伯登。
　　偶然的重逢让二人的内心燃烧得更加激烈，然而与此同时，帝国的间谍“纯血种·受试体E”在皇厅内部暗中活跃，帝国的“特殊任务·女王捕获计划”即将启动。
　　伊思卡和爱丽丝的关系面临撕裂，他们究竟能否对抗这一命运。

　　这一年是2052年，一个前所未有的和平与繁荣的时代遍布全球。原因是:人类已经从疾病和痛苦中解脱出来了。诺贝尔奖得主神经科学家斯金纳博士发明了一种神奇的万灵药，没有明显的缺陷，叫做Hapuna。
　　哈普纳很快变得无处不在……而且必不可少。然而，在Hapuna正式推出后不久，斯金纳博士就消失了。
　　三年后，世界又向前发展了。但斯金纳博士回来了——这一次，他是末日的先兆。斯金纳宣布哈普纳的半衰期很短。所有服用该药的人大约三年后都会死去。死亡即将降临这个罪恶的世界，而且很快就会降临。
　　为了应对这一威胁，一个由5名特工组成的特别任务小组从世界各地聚集起来，从斯金纳的计划中拯救人类。这群人被称为“拉撒路”。他们能在时间耗尽之前找到斯金纳博士并研制出疫苗吗?